Pada tahun 1984, Prof. Dr. KH. Moh. Tholchah Mansoer, SH (alm) menerima Wakaf sebidang tanah seluas 1039 m² di Dusun Tempelsari, Desa Maguwoharjo, Kecamatan Depok, Kabupaten Sleman, Daerah Istimewa Yogyakarta dengan tujuan agar didirikan sebuah pondok pesantren. Sejak saat itu beliau menetapkan niat untuk mendirikan pondok pesantren dan memberinya nama “As-Sunniy Darussalam”. Setelah beliau wafat pada tahun 1986, nadhir wakaf dialihkan kepada Ny. Dra. Hj. Umroh Machfudzoh Tholchah Mansoer dengan ikrar tetap didirikan pondok pesantren. Karena luas tanah dirasa kurang memadai untuk sebuah pondok pesantren, maka nadhir memperluas tanah tersebut sehingga menjadi seluas 2804 m².

Pada perkembangan berikutnya, yayasan mendapatkan tambahan wakaf sebidang tanah seluas 245 m² untuk didirikan Madrasah Diniyyah sebagai rintisan awal berdirinya Pondok Pesantren Sunni Darussalam (PPSD). Berkat rahmat Allah SWT dan bantuan dari berbagai pihak, gedung madrasah diniyyah “Darussalam” tersebut sudah dapat difungsikan sejak tanggal 20 Juni 1993 M. Jumlah santri yang mengikuti kegiatan ta’lim wa ta’allum sebanyak 120 santri dengan rata-rata usia di bawah 20 tahun. Kegiatan ta’lim wa ta’allum PPSD terus mengalami perkembangan. Pada tahun 2000 yayasan mulai membangun gedung berlantai dua di atas tanah seluas 600 m² untuk asrama santri putra yang mondok atau bermukim sebanyak 50 orang. Santri putra tersebut adalah para mahasiswa yang sedang menuntut ilmu di pelbagai perguruan tinggi di Yogyakarta (UIN Sunan Kalijaga, UGM, UNY, UPN, AMIKOM, dan lain sebagainya). Selain santri putra, PPSD juga menerima santri putri yang sampai saat ini berjumlah 50 santri. Dalam hal Kurikulum pendidikan, PPSD menekankan pada kurikulum berbasis keagamaan dengan melakukan kajian-kajian kitab klasik ’kitab kuning’ salafusshalih. Diantara kitab-kitab tersebut adalah; Tafsir Al-Qur’an Al-Jalalain, Riyadl Al-Sholihien, Kifayah Al-Akhyar, Al-Qowaid AlAsasiyyah Li Al-Lughoh Al-Arobiyyah, dll.

Perkembangan lebih lanjut, kegiatan ta’lim wa ta’allum PPSD adalah didirikan gedung Taman Kanak-kanak “Darussalam” Plus di atas lahan seluas 270 m². Dan gedung TK Darussalam Plus tersebut dapat difungsikan atau beroperasi pada bulan Juni tahun 2004. Jumlah siswa/siswi yang bersekolah sampai saat ini berjumlah 200 siswa. Lembaga pendidikan ini pada prakteknya memiliki titik tekan kurikulum pendidikan yang berbasis keagamaan dan menumbuhkan semangat belajar yang kreatif dan inovatif pada anak-anak sejak usia dini. Hal tersebut dapat dibuktikan dengan melihat kualitas siswa/siswi lulusan TK Darussalam Plus yang sudah dapat membaca Iqro’ dan Al-Qur’an dengan lancar bahkan 90% telah khatam 30 Juz Al-Qur’an serta dapat menulis secara tertip dan baik.

Lebih lanjut lagi, kegiatan ta’lim wa ta’allum PPSD memenuhi dan menjawab kebutuhan masyarakat untuk merealisasikan sebuah kegiatan yang tidak hanya bergerak pada bidang keagamaan secara khusus tetapi juga kegiatan yang bergerak di bidang ilmu pengetahuan secara umum Setelah beberapa tahun dengan kesabaran dan keuletan para pengasuh dan keluarga maka pada 2012 dibangun Madrasah Aliyah Darussalam dengan bangunan permanen tiga lantai yang diresmikan pada tanggal 12 Desember 2012 setelah itu tahun berikutnya mulai menerima santri Aliyah yang berasal dari berbagai daerah di pulau jawa seperti Cirebon, Magelang, Banjarnegara, Temanggung dan Sleman sendiri. Perkambangan selanjutnya, setelah berjalan kurang lebih lima tahun Madrasah Aliyah maka atas kesepakatan Yayasan dan Pengasuh maka Pondok Pesantren Sunni Darussalam mulai menerima santri Tsanawiyah pada tahun 2017. Hingga sekarang Jumlah santri yang mukim kurang lebih ada 150 santri yang berasal dari Jawa maupun Luar Jawa. Yayasan ini berdomisili di Dusun Tempelsari, Desa Maguwoharjo, Kecamatan Depok, Kabupaten Sleman Propinsi Daerah Istimewa Yogyakarta.